《神农本草经》又称《本草经》或《本经》，中医四大经典著作之一，起源于神农氏，是现存最早的中药学著作。神农本草经全书分三卷，载药365种，以三品分类法，分上、中、下三品，文字简练古朴，成为中药理论精髓。

《本草纲目》是古代药学著作，明朝李时珍撰。全书共190多万字，载有药物1892种，收集医方11096个，绘制精美插图1160幅，分为16部、60类，是中国古代汉医集大成者。

两本都是中药学专著，两者的差别主要有两个，一个内容，一个应用价值。

神农本草经将药材分为上中下三品，上品可常吃无毒，中品者有小毒，下品者是些泻下，或者有大毒，或者是些矿物药。 本草纲目特点是综合了前人的药材，以及李时珍寻找到的一些民间本草。

神农本草经创作时间不明，语言难懂；本草纲目创作时间较晚，之前已经积累大量临床实践经验，且明代的气候和生物与今天差异较小，应用价值较高。