分类

历史分类

德国生物学家格奥尔格·奥古斯特·戈德弗斯在1830年第一次将原生生物与其它生物区分开来，他使用“protozoa”（原生动物）一词来指代例如纤毛虫和珊瑚等生物 。这一生物分类在1845年被扩展到包含所有单细胞动物，例如有孔虫门和变形虫等。19世纪60年代英国生物学家约翰·霍格第一次提出了 Protoctista 这一正式的生物分类学，他认为原生生物应该包括在他看来原始的单细胞动物和植物。霍格将原生生物定义为“自然界的第四界”，其它三界分别为植物界、动物界和矿物质界 。在1866年，德国生物学家恩斯特·海克尔将矿物质界移出了生物分类学，并将原生生物命名为“protists”，使当时的生物分类为植物界、动物界和代表“原始生命界”的原生生物界 。

一个世纪后，美国生物学家赫伯特·克普兰恢复了霍格的命名方法，他认为“Protoctista”字面意思为“最先建立的生命”，同时他还抱怨称海克尔的命名“protista ”还包括了如细菌在内的无核微生物，而他自己的“Protoctista”命名不包括这类生物。克普兰的命名指代了含有细胞核的真核生物，例如硅藻、绿藻和真菌 。基于这一理论美国生物学家罗伯特·惠特克建立了包含了真菌界、动物界、植物界和原生生物界的四界分类系统 。此后为了与原核生物进行区分，原生生物界只代表真核微生物，而原核生物则被分入原核生物界，这形成了五界分类系统 。这一分类系统一直被广为接受，直到20世纪末。那时分子系统发生学开始得到发展，人们开始意识到原核生物和原生生物两者均不是一类具有相关性生物的集合（他们不是单系群） 。

现代分类

  生物的系统发生和系统发生树，显示真核生物的起源

目前“protist”这一术语被用来指代一系列的单细胞真核生物，这些生物可能以单独细胞的形态或者以群落的形式存在，并且没有分化出特别的组织 。而“protozoa”则被用来指代原生生物中不形成丝状结构的异营生物。这两个属于已经不再在现代生物分类学中使用，而仅仅是用来非正式指代其所代表的生物。

生物分类学中对原生生物的分类依旧在发生变化，较新的分类尝试基于超微结构、生物化学和基因学层面使其指代单系群的生物。由于原生生物整体来看是并系群，因此如上所述的分类方法会使现有的界分类分裂或者被弃用，而不能将原生生物作为真核生物里的一个单独的支线。由Adl et al. (2005)最近提出的一个方案既不会干扰生物分类学的正式分类 ，又可以将生物体编入一个分级编目中，这使得生物分类在相当长的一段时间内可以变得更稳定并易于更新。原生生物分类中有一些被认为是门分类的已经在本文右侧的信息框中列出 ，其中有很多被认为是单系群，但是目前仍缺乏证实。例如古虫界生物可能不是单系群的，又例如只有当定鞭藻门和隐藻门被排除在外时，囊泡藻界生物才能说是单系群的 。

特征

原生生物是简单的真核生物，多为单细胞生物，亦有部分是多细胞的，但不具组织分化。这个界别是真核生物中最低等的。

制造养分的方式，有的跟真菌一样，吸收外间的营养；有的能行光合作用，亦能捕食，例如裸藻。

所有原生生物都生存于水中。

常见的原生生物包括纤毛虫（ciliates）、变形虫、疟原虫、粘菌、浮游生物、海藻，也有光自营的单细胞游动微生物，如眼虫等。

营养方式

几乎所有的原生生物都进行有氧呼吸。他们的营养方式也是真核生物中变异最大的，有些为自营，有些为异营，还有些为混合营养的，可行光合作用和异养。因此可用营养方式将原生生物分为三群:

类似植物

类似植物的藻类，一含有叶绿体， 能进行光合作用的自营营养方式。

类似菌类

类似菌类的原生菌类，一吞噬有机物或分泌酵素，分解并吸收有机分子的异营营养方式。

类似动物

类似动物的原生动物类，一吞噬大食物而为异营的营养方式 。

原生生物

真核生物除动物、植物、真菌三界之外统称 原生生物 ，为并系群。

等辐骨虫纲（Acantharea），如等棘虫。

放射虫纲（Polycystinea）

双滴虫类（Diplomonadida），如曲滴虫、贾第虫。

副基门（Parabasalidea）

透色门Percolozoa或叶足门（Heterolobosea），如集胞菌。

眼虫门（Euglenozoa）

隐藻纲（Cryptophyta）

定鞭藻纲（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。

不等鞭毛类（Heterokonta），除下列分类还包括辐球虫、蛙片虫等。

囊泡虫类（Alveolata）

单孢子虫门（Haplosporidia）

丝足虫类（Cercozoa）

根肿菌类（Plasmodiophorida）

粒网足虫类（Granuloreticulosea），如有孔虫。

叶足纲（Lobosea），如变形虫（阿米巴）。

黏菌门（Mycetozoa）

原始色素体生物（Archaeplastida）

注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未归类 原生生物 。

参见

有性生殖的演化

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