刘肇基(?-1645年),字鼎维,辽东人。
原籍赣榆县,祖辈世袭指挥佥事。肇基随父入军籍。崇祯七年随总兵尤世威镇压农民起义。蓟辽总督洪承畴调肇基至辽东,负责训练士兵。顺治二年(1645年)三月,清将多铎兵围扬州,史可法传檄诸镇发兵援救,刘泽清北遁淮安。仅刘肇基等少数兵至,入城守北门,防守见绌。扬州城破被杀。