巫医起源甚早，《大荒西经》云：“有灵山，巫咸、巫即、巫彭、巫姑……十巫从此升降，百药爰在。”《离骚》中有二次提到“彭咸”。王逸《楚辞章句》注称“彭咸，殷贤大夫，谏其君，不听，自投水而死。”《说文》称“古者巫咸初作巫”。巫医的医疗过程中掺杂许多符咒与迷信。
周朝后期，巫与医开始分歧，《论语·子路》曾记载“人而无恒，不可以作巫医”，《十三经注疏》说：“巫主接神去邪，医注疗病”。《论衡·言毒》载：“巫咸能以祝延人之疾”。到了唐朝仍有巫医的行业，韩愈《师说》：“巫医乐师百工之人，君子不齿。”。今日医学昌明的时代，巫医往往被视为神秘和迷信。
