最早的马氏家谱修于何时已不可考，但是，作为汉代的名门望族，马姓在东汉时已有家乘谱牒。唐宋之际，谱牒之学大兴，加之马姓名人辈出，马氏修谱也蔚为大观。明清之际，随着时代潮流的发展，马氏修谱更至高潮，甚至一些少数民族马姓也开始兴修家谱。例如道光年间辽宁满族马佳氏（后改为马姓）修有《马佳氏族谱》，同治年间云南玉溪回回马氏修有《玉溪龙门马氏宗谱》。解放后，大陆马氏曾一度停止修谱，而港台地区仍然流行。最近几年，大陆马氏又开始续修、整理家谱。

历来马氏都非常重视修谱，并且将家谱视为维系整个马姓家族的圣物，这在马氏家谱的序文中一般都有体现。例如，每次修谱都先注明受领人的姓名，开列谱牒部数。同时，又非常重视族谱的收藏保管，要求子孙不得胡乱涂改，不能让虫鼠咬蚀，更不能出典等，否则严惩不贷。