谱牒作为民间族人生活实录的史籍，是我国宝贵文化遗产的一部分，有其重要的学术价值。根据古往今来的研究与分析，它的缺陷也是显而易见的，主要表现在四个方面：

一、在撰修的组成人员上，随着期届的不同而不同，没有什么人对撰修班底进行训练或鉴别，也无须对史、谱进行严格的考证研究，参修人员良莠不齐，有的“主持人甚至是白丁”，这就很难保证撰文内容的真实可靠和谱牒整体的质量。就谱牒内容而言，只要族内认可即可，若有虚构、造作，也无须他审，这是导致谱牒不实的根本原因所在。

二、世系的虚构，尤其是远古世系的虚构，是所有缺陷中表现得最突出的一个方面，所谓“凿凿精实，百无二三”，只能作“有识者喷饭之助矣”。自宋至今批评的重点也就在这里。只要是世系不实的这类谱牒，也就失去了它的史料价值。

三、有过多的虚华赞颂，空洞无物，洋洋千言，尽为堆叠之词。根据笔者曾经历过的体验，产生这些问题，一方面是由于执掌人为标榜近亲所为而达到扬名、称誉于族的目的而大力渲染；另一方面，由于族亲的关系，对族内的阴暗面揭露不够，哪怕纵有劣迹于世，也不能如实记述，还持以“隐恶扬善，为讳，为亲者讳”的态度而“子为父隐”。作为史料，谱牒不能达到真实可靠。

四、民间修谱，是族自所为，无须对族外社会和历史负责，社会也没有为此而监督审核的责任，这是谱牒修撰过程中的体制性缺陷，因为这是“私家之谱，不登于朝”，即便产生一些问题也只局限在这个族众的内部，也正是因为有这些缺陷的存在，致使一些讹误长期存在，后续修谱也只得这样循环下去了。

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