生平

因为主君堀秀村继承城主之位时年纪尚幼，因此樋口直房作为家老辅佐，掌握了镰刃城的实权。当时堀秀村仍从属于北近江大名浅井长政，据说，竹中重治在谋夺稻叶山城又弃城离开后，前往近江时，就是接受樋口直房的庇护。樋口直房雅好连歌、茶道，并有相当的造诣，同时对领下内政十分用心，留有多封有关领地施政的文书。

由于浅井长政在元龟元年（1570年）的金崎之战后，与织田信长反目成仇后，浅井家为防备织田家的来袭，新建长比、苅安两处城砦并交给堀秀村跟樋口直房镇守。樋口直房受到颇有交情的织田家臣竹中重治劝诱决定改投织田家，甚至还说动主君堀秀村一同反出浅井氏。

元龟二年（1571年）5月，浅井长政派遣家臣浅井井规进攻镰刃城，多得横山城守将木下藤吉郎及时驰援，堀秀村跟樋口直房顺利击退浅井军。（箕浦之战）

天正元年（1573年），在浅井家于小谷城之战灭亡后，堀秀村因功加封坂田郡6万石。但好景不常，在天正二年（1574年）时，越前一向一揆南下攻打近江时，樋口直房奉命负责防备木目城，但因为近江、敦贺援兵来不及赶到，所以樋口直房便开城向一向一揆的将领下间赖照请降。

樋口直房将城池交给一向一揆后，便带着妻子逃往甲贺，此举被织田信长怀疑跟一向一揆内通，命令羽柴秀吉逮捕樋口夫妇并处死，其首级也被送往长岛让织田信长检视。而堀秀村作为樋口直房的主君，也遭到织田信长连坐处罚，没收领地放逐。

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