内含子相位

内含子可以出现在转录抄本的任何位置，甚至在以后成为密码子的三核苷酸之间。若内含子位于一密码子的第三位核苷酸和另一密码子的第一位核苷酸(即两密码子之间)，则被称为 0位内含子 。相应地，位于一密码子第一第二位核苷酸之间的内含子被称为 1位内含子 ，位于第二和第三位之间时，则被称为 2位内含子 。这在外显子复制中很重要，处于两同相位内含子的外显子被称为对称外显子，其核苷酸数为3的整数倍，它可以被成功复制，不会造成阅读框的推移。相反，非对称外显子是不可复制的。

内含子类型

根据剪接过程为自发还是要经过剪接体的加工，人们将内含子分为 自剪接 和 剪接体 内含子。

自剪接内含子

在1981年由汤玛斯·切希发现的自剪接内含子中，又分为:

I型内含子 存在于线粒体、叶绿体及某些低等真核生物的rRNA基因中，极个别的存在于原核生物的噬菌体中

II型内含子 主要见于细胞器(如线粒体)、细菌中

剪接体内含子

这类内含子的剪除要有剪接体的帮助。一段序列在剪接中是内含子还是外显子，取决于其自身。包括Ⅲ类内含子和Ⅳ类内含子

内含子的起源与进化

GT-AG-内含子

最常见的内含子是所谓的GT-AG-内含子。它以GU开头并以AG结尾。

AT-AC-内含子

AT-AC-内含子则是以AU开头，AC结尾。

参见

外显子

基因表达

蛋白质生物合成

分子生物学的中心法则

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