分类大多数人类所感兴趣的次级代谢产物被放入基于其生物合成来源分类的分类。因为次级代谢产物常由被修饰的初级代谢产物合酶生产出来，或来源于从初级代谢产物上“借来”的底物，这些分类方法不应该被解读为：分类中的所有分子都是次级代谢产物（例如甾体化合物类），相反地，只是说这些次级代谢产物存在于这些分类中。小“小分子”生物碱（通常是小分子，主要衍生于氨基酸）：萜类化合物（源自半萜的低聚物）：糖苷（主要衍生于糖类分子）：天然酚：吩嗪：较大“小分子”，由较大且模块化的“分子工厂”生产出来聚酮：脂肪酸合酶产品：非核糖体多肽：以上三种的混合体：多酚非“小分子”，脱氧核糖核酸、核糖核酸或多糖类“经典”生物聚合物核糖体多肽：另见次级代谢毛状根培养，用于植物组织培养的策略以生产出高工程量的高附加值次级代谢产物

关键的生化物质动植物和微生物的大部分组成结构是由三类基本生物分子所构成，这3类分子是氨基酸、糖类和脂类（通常为称为脂肪）。由于这些分子是维持生命所必需的，代谢既制造这些分子以用于构建细胞和组织，又在摄入食物后将食物中的这些分子消化降解以提供维持生命所需的能量。许多重要的生化物质可以聚合在一起形成多聚体，如DNA和蛋白质。这些生物大分子对于所有的生物体都是必要的组分。下表中列出了一些最常见的生物大分子。氨基酸和蛋白质人源I型乙二醛酶的结构。蛋白质是由线性排列氨基酸所组成，氨基酸之间通过肽键相互连接。酶是最常见的蛋白质，它们催化代谢中的各类化学反应。一些蛋白质具有结构或机械功能，如参与形成细胞骨架以维持细胞形态。还有许多蛋白质在细胞信号传导、免疫反应、细胞黏附和细胞周期调控中扮演重要角色。脂类三酰甘油的结构。脂类是类别最多的生物分子。它们主要的结构用途是形成生物膜，如细胞膜；此外，它们也可以作...

例子在“H++H2O->H3O+”中，H3O+是这个化学反应的产物。参见反应物底物过渡态中间体

历史定义代谢症候群的定义曾经多次改动，目前仍在使用的定义也有好几种，其差异可能来自对于代谢症候群的切入点的不同所致。影响力较大的几种定义如下：1998世界卫生组织（WHO）定义世界卫生组织对于代谢症候群的定义自从糖尿病的面向出发。其定义标准为，在糖尿病或空腹血糖偏高或葡萄糖耐受不良或胰岛素抗性（整个族群当中，进行euglycemichyperinsulinemicclamp结果最不佳的四分之一）的状态，合并有以下情况二者及以上者，即为代谢症候群：肥胖（男性腰围除以臀围比率大于0.9、女性大于0.85），或身体质量指数在30以上者。脂质代谢异常：三酸甘油脂大于等于150毫克/公合或高密度脂蛋白胆固醇过低（男性低于35毫克/公合、女性低于39毫克/公合）。血压大于140/90毫米汞柱。微白蛋白尿（microalbuminuria），指白蛋白的尿液排除率（excretionrate）大于20μg...

概览代谢途径一般都有以下特征：它们包括多个步骤，就像瀑布一样。首个步骤多数不能倒逆。其他步骤并不一定不能倒逆。大部分情况下，这些步骤可以视乎细胞的实际需要而倒逆。它们都是有调节的，一般是以反馈方式，或是以循环形式再次进行反应（如三羧酸循环）。真核生物的合成代谢及分解代谢途径，大都局限于细胞中的特定区域（细胞区室），或是以使用不同的酶或辅助因子来分开。主要代谢途径葡糖醛酸代谢戊糖相互转换肌醇代谢纤维素与蔗糖代谢淀粉与糖原代谢其他糖类代谢磷酸戊糖途径糖酵解与糖异生氨基糖代谢小氨基酸合成支链氨基酸合成嘌呤生物合成组氨酸代谢芳香族氨基酸合成丙酮酸脱羧发酵脂肪酸代谢尿素循环天冬氨酸族氨基酸合成卟啉类和类咕啉代谢三羧酸循环谷氨酸族氨基酸合成嘧啶生物合成细胞呼吸细胞会使用多种不同但相关的代谢途径来转移由分子分解释放的能量至ATP内。这种作用会以不同的形式存在于所有生物之内：糖酵解厌氧呼吸三羧酸循环氧化磷...