发展历史

分子生态学开始于1950年代。是随着DNA双螺旋结构的发现，分子水平的群体遗传学研究得以开展，相继出现了同工酶电泳、限制性内切酶酶切技术、分子克隆和DNA测序技术等，使遗传变异研究得以实现, 并可以在群体水平进行检测。分子进化的中性理论的提出，引发了适应性进化和中性进化的争论，推动了群体遗传学和分子进化研究，分子钟假说的提出和谱系进化关系重建理论、方法、算法和软件的出现, 进一步促进了分子进化和分子群体遗传学研究的发展。

到了1980年代，DNA聚合酶链反应的发明和热稳定DNA聚合酶的发现，进一步推动了分子生态学和分子群体遗传学研究。1992年《Molecular Ecology》的创刊，标志着分子生态学的建立。溯祖理论、贝叶斯方法和马尔可夫过程等的引入，提升了分子生态学研究的可靠性。

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