建立

波斯尼亚战争可以分为三个阶段，第一个阶段当中，波斯尼亚的民兵要对抗的是当时驻在波斯尼亚的南斯拉夫人民军，使人民军撤离波斯尼亚。

1992年5月，战争转变到第二阶段，在这个阶段当中，波斯尼亚的克罗地亚裔与穆斯林联合对抗波斯尼亚的塞尔维亚裔。这些塞裔在1月宣布成立“波斯尼亚和黑塞哥维那塞族共和国(Republika srpskog naroda Bosne i Hercegovine)”，8月又更名为 塞族共和国 。塞裔藉其优势，将原先占有55%的土地扩张到约70%左右。之后，塞裔的战斗的目标转向波斯尼亚东北部，他们计划在这区建立一条连接塞尔维亚本土与塞尔维亚克拉伊纳共和国地区的走廊，并在1992年10月达成这项计划后。

1993年春天，战争转换到第三个阶段。为了争夺领地以及莫斯塔尔市的所有权，原先合作对抗塞裔的克裔及穆斯林之间爆发了战争。克裔想要以莫斯塔尔做为国家的首都，他们称这个国家为“黑塞哥-波斯尼亚共和国”有别于穆斯林的“波斯尼亚和黑塞哥维那共和国”。

合并

这样的局势维持了一段时间，在这段期间内产生了一些以民族主义观点来看非常吊诡的事情。克裔为了躲避穆斯林的攻击，躲到塞裔的阵地后面，而塞裔后来还护送他们安全回到自己的地区。这时候，塞裔主要是在持续对萨拉热窝施压，并且巩固他们已经占有的地区。直到1994年3月，签属了华盛顿协议，局势才开始又有所转变。这项协议在波斯尼亚建立一个由穆斯林与克裔组成的 波斯尼亚和黑塞哥维那联邦 ，克裔与穆斯林再度站在同一阵线。

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