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组蛋白

2020-10-16
出处:族谱网
作者:阿族小谱
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历史于1884年,艾布瑞契·科塞尔首先发现组蛋白。直至1990年代早期,组蛋白才被更多认识,并非纯粹细胞核的填充料。及后它的调控功能才被发现。分类现时已知的组蛋白并有六种,分别为H1(有时称为连接组蛋白H5)、H2A、H2B、H3、H4及古细菌组蛋白。在H2A、H2B、H3及H4这四种组蛋白中的其中两种称为“核心组蛋白”,并且集合成为八聚体的核小体核心颗粒。这种集合是将DNA的146对碱基对以1.65左手超螺旋形围在这个蛋白质线轴。连接组蛋白H1将核小体核心颗粒与DNA的进入位点及E位点结合,因而可以将DNA紧扣在位,并且能容许形成更高层次的结构。最基本的形状为一个10纳米的纤维或一连串的珠子。这涉及将在每一个核小体之间约50对的DNA碱基对围在这些核小体上,这些DNA又称为连接DNA。较高层次的结构包括有30及100纳米的纤维,是在一般细胞内的结构。在减数分裂中,透过核小体与其他蛋白质的...

历史

于1884年,艾布瑞契·科塞尔首先发现组蛋白。直至1990年代早期,组蛋白才被更多认识,并非纯粹细胞核的填充料。及后它的调控功能才被发现。

分类

现时已知的组蛋白并有六种,分别为H1(有时称为连接组蛋白H5)、H2A、H2B、H3、H4及古细菌组蛋白。

在H2A、H2B、H3及H4这四种组蛋白中的其中两种称为“核心组蛋白”,并且集合成为八聚体的核小体核心颗粒。这种集合是将DNA的146对碱基对以1.65左手超螺旋形围在这个蛋白质线轴。连接组蛋白H1将核小体核心颗粒与DNA的进入位点及E位点结合,因而可以将DNA紧扣在位,并且能容许形成更高层次的结构。最基本的形状为一个10纳米的纤维或一连串的珠子。这涉及将在每一个核小体之间约50对的DNA碱基对围在这些核小体上,这些DNA又称为连接DNA。较高层次的结构包括有30及100纳米的纤维,是在一般细胞内的结构。在减数分裂中,透过核小体与其他蛋白质的相互作用,合成染色体。合成的组蛋白与DNA称为染色质。

核心组蛋白是高度保守的蛋白质,意即组蛋白在氨基酸序列中有着非常小的改变。连接组蛋白通常有着多于一种的形状,对比核心组蛋白是保守程度较低的。

在主要的组蛋白类别中,亦存在一些异构体。它们有着相同的氨基酸序列及相似的核心结构,但却有着不同的特征。这些不同的组蛋白通常带着染色质的特别功能,就如与H3相似的CenpA是唯一的组蛋白与染色体的着丝点联合;H2A的异构体H2A.Z是与活性转录基因联合与涉及在异染色体的形成;另一个H2A异构体H2A.X以双链断裂与DNA结合,并进行DNA修复。

H1

组蛋白H1有着一个中央球状结构域及长的C与N端尾巴,能将小珠子串结构围成30纳米大小的螺线管结构。对比其他种类的组蛋白,H1的数量只为其他的一半。这是因为它不是构成核小体部分,而只是将DNA及核小体紧扣在一起。H1亦有着它的异构体,称为组蛋白H5。

H2A、H2B及H4

组蛋白H2A、H2B及H4同样有着一个主要的球状结构域与长的N端尾巴,是组成小珠子串结构内的核小体的重要原素。

H3

与组蛋白H2A及H2B类似,组蛋白H3有着一个主要的球状结构域与长的N端尾巴,是组成小珠子串结构内的核小体的重要原素。它的N端尾巴从球状核小体核心伸出,能进行多种影响细胞运作的表观遗传修饰。这些修饰包括将甲基及乙酰基共价附着于离氨酸或精氨酸,及丝氨酸或羟丁氨酸的磷酸化。离氨酸9的甲基化涉及基因沉默及在DNA内形成相对较不活跃的异染色质。组蛋白H3的乙酰基化会在组蛋白尾巴内不同的离氨酸位置出现,并且由组蛋白乙酰转移酶(HAT)所催化。离氨酸14的乙酰基化在基因中很普遍,亦会转录成为核糖核酸(RNA)。

结构

核小体核心颗粒是由两个H2A-H2B二聚物及两个H3-H4二聚物结合而成,形成两半接近对称的三级结构(2阶旋转对称,即1个高分子是另一个的镜像)。H2A-H2B及H3-H4二聚物本身亦呈现伪双向对称。

这四个核心组蛋白(H2A、H2B、H3及H4)是在结构上相似及在进化中高度保存的,所有均有着一个“螺旋缠绕螺旋缠绕螺旋”的形状,可以容许简单的二聚化。它们在氨基酸结构上都有着一条长的尾巴,让转录后修饰的进行。

总括来说,组蛋白与DNA有着五种的相互作用:

H2B、H3及H4的α螺旋两极积聚正电,能与DNA的带有负电苛的磷酸盐分子团产生相互作用。

在DNA骨干与氨基之间的氢键对组蛋白的主链。

组蛋白与DNA的脱氧核糖的非极性相互作用。

碱性氨基酸(如离氨酸及精氨酸)旁链与DNA磷酸氧旁链之间的盐连及氢键。

H3及H2B的N端尾巴的非特定副槽面插入至DNA分子的两个副槽面。

组蛋白最重要的基本性质,除了是协助与DNA的相互作用外,就是它的水溶性。

组蛋白的翻译后修饰会先在它的N端尾巴开始,再而在其球状结构域进行。这种修饰包括有甲基化、瓜氨化、乙醘基化、磷酸化、小泛素相关修饰化、泛素化及二磷酸腺苷核糖基化。这些影响着组蛋白在基因调控的功能。

一般来说,活性的基因较少与组蛋白联系,但非活性的基因会在间期中与组蛋白联合。组蛋白的结构在进化上保存,这是因为任何有害的突变会造成严重的不适应性。

功能

填充蛋白质

组蛋白作为DNA折曲的线轴,这种压缩能让出细胞核内的空间予较大的基因组。压缩后的分子长度大约只有之前的 1 50 , 000 {\displaystyle {\frac {1}{50,000}}} 。

染色质调控

组织蛋白进行翻译后修饰,以更改它与DNA及其他核蛋白的相互作用。组织蛋白H3及H4有有着核小体伸出的长尾巴,能够在不同的地方进行共价修饰。这种修饰包括有甲基化、瓜氨化、乙酰基化、磷酸化、小泛素相关修饰化、泛素化及二磷酸腺苷核糖基化。组织蛋白核心(即H2A及H3)亦可以作出修饰。修饰的组合可以组成编码,成为组织蛋白编码。组织蛋白修饰在不同的生物过程起着作用,包括基因表观调控、DNA修复、有丝分裂及减数分裂 。

组织蛋白修饰的命名是:

先以组织蛋白名称开始,如H3;

单一字母的氨基酸简称,如K代表赖氨酸,及在蛋白质的位置;及

修饰的种类,Me即甲基化、P即磷酸化、Ac即乙酰化及Ub即泛素化。

举例来说,H3K4Me就代表组织蛋白H3从N端开始起计第4个赖氨酸的甲基化。

参见

染色质

基因沉默

遗传学

组蛋白去乙酰酶

核小体

 

 


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