细胞基础

在细胞损伤后，多细胞生物的组织结构形成是由基因表达调控（英语：Regulation of gene expression）所决定。神经细胞释放一些与快速生长相关的蛋白质，如Gap-43蛋白（英语：Gap-43 protein）、微管蛋白、肌动蛋白以及数组神经肽（英语：Neuropeptide）和细胞因子从而诱导损伤细胞生理反应从而再生。许多参与的基因在组织的原始再生中被重新激活。在斑马鱼的原基细胞中，再生过程由msx家族的4个同源异形基因所调控。

组织

“使用成年人的体干细胞的去分化或/和转分化细胞，包括组织结构预先重新排列的规则，可以在相同动物的不同组织中表达并重建出与周围相适应的组织极性、结构和形式。”在该发育过程中，基因被重新激活用于改变不同组织的分化能的性质。发育及再生涉及到把细胞群协调及组织成胚基（英语：blastema）（干细胞再生开始时的细胞基团）。细胞的去分化意味着他们在再生过程中失去了那些组织特异性的功能。不应该同转分化混淆，转分化指的是细胞在再生过程中失去了其组织特异性，然后重新分化成不同类型的细胞。

两侧对称动物

涡虫（扁形动物）

涡虫再生能力极强。举例来说，涡虫可以纵向或者横向分裂成两个不同个体。在一项科学实验中，T. H. Morgan发现，涡虫只需要其1/279一块即可以成功再生为一个新的蠕虫。这个大小（约10,000个细胞）通常被认为是涡虫可再生为一个新的个体的最小片段。涡虫的再生属于割处再生，即截断后，断处的细胞形成胚基。

脊椎动物

两栖动物

一些简单点的动物如花虫类动物（英语：planarian）具有很强的再生能力。因为拥有需要长时间保持自己的身体形态免遭破坏而随时起作用的干细胞（neoblast）。受伤后，他们会分裂和分化出缺少的组织和器官。这个过程在脊椎动物里要复杂得多，但尽管如此，蝾螈断肢后仍有很强大的再生能力。蝾螈的肢体再生已经被作为一个课题被广泛研究中。

蝾螈的肢体再生主要分为2个步骤，首先成熟细胞去分化成类似胚胎干细胞的状态，其次这些细胞发育成新的组织。

肢体断掉后，在不到12小时内，表皮会增生覆盖断枝的截断面，形成所谓的顶端上皮帽（AEC）。在接下来的几天时间里，残存的细胞去分化形成胚基（英语：blastema）（大量去分化增殖的细胞）。随着胚基的形成，一些用于形成胚胎的基因，如HoxA与HoxD被激活。肢体的远端（如手或脚）尖端形成第一个胚基。而在其中间部位随着胚基的发育逐渐被填充。肢体的运动神经元（英语：Motor neuron）、肌肉和血管再生，并与断枝相匹配。整个过程的时间随着生物年龄的不同而有所变化，成熟个体肢体功能完全恢复的时间大约为一个月到三个月时间。

尽管历史上只有少数人员从事研究肢体再生的工作，但最近已经把作为基因模型生物的蝾螈（Ambystoma mexicanum）进行研究取得重大进展。这一进展已经促进了基因组学，生物信息学、体细胞遗传子导入及其他领域的发展，也创造了重要生物学特性进步的机会，如在蝾螈上发现的肢体再生。钝口螈的遗传资源保藏和利用中心（AGSC）是由美国国家科学基金会支持的对蝾螈的再生、繁殖所进行研究的一个组织。该组织位于肯塔基的大学，AGSC是专门为在美国各地和国外供应以良好基因为特点的蝾螈的胚胎、幼虫和成熟个体的实验室。美国国立卫生研究院资助了该项蝾基因组计划（SGP），且已建立第一个以两栖动物基因图谱和附加因子为主的数据基地，并建设了研究界的门户网站 。

研究人员在澳洲的蒙纳士大学再生医学研究所出版了一本书籍，当移除吞噬碎片的巨噬细胞时，蝾螈的再生能力丧失，组织被瘢痕组织所代替。

哺乳动物

再生的机制在墨菲罗斯大鼠中被发现，并且与p21基因的失活有关。

至少两种刺毛鼠属，分别是Acomys kempi与Acomys percivali，能够完全再生由自割受损的组织。这些物种可再生毛囊、皮肤、汗腺、毛皮和软骨。

与大多数脊椎动物的胚胎/幼兽相比，哺乳动物中蝾螈和鱼的成熟个体具有有限的再生能力。但Robert O. Becker（英语：Robert O. Becker）的使用电刺激的再生治疗疗法，已经在大鼠以及一般哺乳动物现了不错的效果。

墨菲罗斯大鼠（MRL）是小鼠属中表现再生能力最强的品种。研究在正在研究这些动物并试图把这种能力应用到人类身上。

通过比较愈合良好的MRL鼠和愈合不良的C57BL/6（英语：C57BL/6）鼠的基因表现差异，已经确定36个基因用于决定这种愈合能力。

MRL鼠的再生能力保护他们免于心肌梗死，成年哺乳动物心肌细胞的再生是十分局限的，因为心脏的心肌细胞几乎都处于G0期（英语：G0 phase），即终末分化期。MRL鼠在心脏病发作后同一般的鼠类的心肌损伤和瘢痕组织数几乎一样，然而，根据最新的研究证明，这种情况并非永远如此，心脏损伤后的MRL小鼠能够再生损伤部位的组织。

人类

有关人体再生请看下列。

手指

在1932年5月，L.H. McKim在《加拿大医学协会杂志》上发表了一份报告，它描述了一个成年人手指指端缺损的再生。家庭外科医生在蒙特利尔总医院（英语：Montreal General Hospital）做了末端指骨截肢手术以防止感染蔓延。在不到一个月的手术后，X-射线分析表明骨已经再生完成，而肉眼观察发现指甲和皮肤也已再生。他是成年人手指指端再生的最早记载例子之一 。

在20世纪70年代的研究发现，10岁左右的儿童意外失去手指指端，事实上可以在一个月内再生自己的手指指端而不是皮肤的简单愈合。再生的手指通常不会有指纹，而且如果有任何一块手指甲留下来的话都可以再生，再生出来的指甲一般为方形而不是圆形。

在2005年8月，Lee Spievack在他六十多岁的时候不小心切掉右手中指尖端正上方的指骨。他的弟弟Alan Spievack博士是研究再生的，并且给他提供了细胞外间质，由麦高文学院再生医学的Stephen Badylak博士开发。Spievack先生首先将粉末覆盖伤口附近，他的手指尖端在接下来数周的时间成功再生。该消息发布于2007年，也是第一位成年人手指尖端成功再生的报导案例。然而，Ben Goldacre（英语：Ben Goldacre）形容它是“手指从来没有丢失”，并引用利兹大学手外科的西蒙凯教授看过Goldacre提供的图后说的“相当不起眼的普通的指尖损害与愈合”的话。

CNN也报导过类似的案例。一位名叫Deepa Kulkarni（英语：Deepa Kulkarni）的妇女失去了她的小拇指指尖，医生告诉她做什么都无法挽回了。她个人请了多位专家，包括Badylak，最终她接受了再生疗法，并成功再生出了她受损的指尖。

脚趾

脚趾发生坏疽或老年人脚指头烧伤也可以在坏疽治疗后再生出脚趾及趾甲。

肋骨

目前已经证明，人类的肋骨可以再生，如果骨膜及周围的肋骨膜未发生损害。在一项研究中用肋骨材料帮助头骨进行重建的12例患者的肋骨切除手术后发现肋骨发生了完全再生。

肝脏

人类的肝脏具有极强的再生能力，哪怕肝组织被切除到只有四分之一大小，主要是因为肝细胞的分化能所致。肝切除能诱导剩余肝细胞的增殖，直到失去部分被恢复，其中肝脏反应灵敏度直接与被切除的质量相关。啮齿类动物的肝脏切除已经作为一个模型被研究了80年，用来研究细胞的增殖。

肾脏

肾脏的再生能力仍然未被开发。肾脏的基本功能和结构单元是肾单位，它主要由肾小球，肾小管，集合管和肾小管周围毛细血管四部分组成。相比而言，属于脊椎动物的哺乳动物的肾的再生能力是有限的。

在哺乳动物肾中，我们已经可以知道肾小管的急性损伤是可以再生的。最近的研究还发现了肾小球的再生。在急性损伤时，近端小管更容易受伤，而基底膜受伤的上皮细胞脱落成为肾单位。尚存的上皮细胞，经过迁移、分化、增殖和再分化补充损伤后的近曲小管上皮内层。最近，由肾脏的参与干细胞的肾小管再生已经被发现了。而后，肾干细胞的概念被提出。除了尚存的肾小管上皮细胞和肾干细胞，骨髓干细胞也被证实参与了近端小管的再生，然而，该机制仍然存在争议。最近，研究关于骨髓干细胞分化成肾脏细胞的能力的文章不断出现。

与其他器官一样，肾脏还可以在如鱼类等低等脊椎动物中完全再生。一些已知的鱼类，如金鱼、鳐鱼、?鱼和鲨鱼的肾脏再生能力都很强。在这些鱼中，肾被部分切除后都能完整再生。

心脏

只有少数动物心脏可以再生，哺乳动物的心肌（心肌细胞）仍有再生潜能（过去认为完全不能再生、但新研究认为仍有有些许再生能力），一旦心脏损害则会引起疤痕和纤维化。

有种长期存在的观点认为，哺乳动物的心肌细胞是终末分化，并不能分裂。然而抑制p38的MAP激酶，发现在成年哺乳动物的心肌细胞中能诱导出有丝分裂。用大鼠做实验，通过用FGF1和p38 MAP激酶抑制剂心脏的再生，能够减少瘢痕形成并提高心肌损伤的程度。

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