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生物化学性质蛋白质结构中氨基酸和丙氨酸通过肽键（用方块标出）连接在一起。肽键的共振结构。氨基酸通过肽键连接在一起形成蛋白质聚合物。蛋白质是由不同的L型α氨基酸所形成的线性聚合物。目前在绝大多数已鉴定的天然蛋白质中发现的氨基酸有20种（参见标准蛋白氨基酸列表）。不过在自然界中还存在着一些特殊的氨基酸，例如在一种海洋寡毛纲小蠕虫Olaviusalgarvensis以及与之存在共生关系的细菌δ1（该细菌属于δ变形菌）中存在着高含量的硒代半胱氨酸，由原本为终止密码子的UGA编码，和吡咯赖胺酸，由终止密码子UAG编码。所有氨基酸都有共同的结构特征，包括与氨基连接的α碳原子，一个羧基和连接在α碳原子上的不同的侧链。但脯氨酸有着与这种基本结构不同之处：它含有一个侧链与氨基连接在一起所形成的特殊的环状结构，使得其氨基在肽键中的构象相对固定。标准氨基酸的侧链是构成蛋白质结构的重要元素，它们具有不同的化学性质...

氨基酸合成将氨基酸聚合就可以得到蛋白质。氨基酸合成是一系列的生物化学过程（代谢途径）将从葡萄糖等建立氨基酸。并非所有氨基酸都可以生物合成，例如成人必需的20中氨基酸中，就有8种氨基酸是人体无法自身合成的，需要从食物中摄取。氨基酸会被运送至转运RNA（tRNA）用在翻译的过程。转录图中显示转录过程。英文待翻译。转录是由基因组产生含有蛋白质序列的信使RNA（mRNA）模板，以进行翻译。只需要脱氧核糖核酸（DNA）双螺旋的其中一条链就能进行转录，此链称为模板链。转录分为三个阶段：核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶）先与DNA的用作转录起始的特别区域结合。这个结合区域称为启动子。当RNA聚合酶与启动子结合后，该DNA链会开始卷开。第二个转录步骤是转录延伸。RNA聚合酶与未编码的模板链一起，合成核糖核苷酸聚合物。RNA聚合酶并不会使用已编码的链为模板，这是因为任何一股的拷贝会生产一组补充的基础序列，所以只...

主要类型内在膜蛋白是整合于膜上的蛋白质，总是与膜结合在一起。可以定义为需要通过人工加入去垢剂（如SDS或TritonX-100）或其他非极性溶剂才能够从膜中分离出来的蛋白质。内在膜蛋白还可以根据与双分子膜之间结合关系的差异细分为：外周膜蛋白是能够暂时与膜或内在膜蛋白结合的蛋白质，主要是通过疏水、静电和其他非共价相互作用来进行结合，这种结合可以通过加入极性试剂，如高pH或高盐溶液来破坏。内在膜蛋白和外周膜蛋白都可以被翻译后修饰，如加上脂肪酸链和异戊二烯化（Prenylation），有助于与脂膜的结合。参见内在膜蛋白外周膜蛋白离子泵运输蛋白离子通道受体参考文献延伸阅读Protein-lipidinteractions(Ed.L.K.Tamm)Wiley,2005.PopotJ-L.andEngelmanD.M.2000.Helicalmembraneproteinfolding,stabili...

分布与形态各种质粒体的关系图蛋白质体是一种特化的白色体，主要功能为蛋白质的储存及提供与涉及这些蛋白质的酵素作用部位。蛋白质体常被发现于分生组织、表皮和根冠细胞中，也常在种子现，如花生和巴西坚果的种子。和其他质粒体一样，蛋白质体带有自己的环状基因。根据内共生理论，质粒体可能起源于早期原核生物和真核细胞的共生。除了蛋白质体之外，特化为储存功能的白色体还有淀粉体（Amyloplast,储存淀粉）和油粒体（Elaioplast,储存脂质）。相关除了蛋白质体之外，糊粉粒（aleuronegrain）也是常见于植物细胞的蛋白质储存形式，例如禾本科植物种子胚乳外层特化的糊粉层。糊粉粒位于细胞质中，除了无定形的蛋白质外，还含有蛋白质的晶体和非蛋白质的球状体（如脂质）。糊粉粒通常储存不活化、稳定的蛋白质，和蛋白质体以结晶的形式储存活化的蛋白质有所不同。参见原质粒体白色体