背景

1970年代之后，被子植物的分类系统似乎到达一个稳定的状态，借助于新技术从事传统的分类学研究，并由于此类资料的大量累积，当时仍极为常用的克朗奎斯特分类系统(Arthur John Cronquist，1919年3月19日－1992年3月22日)及塔赫塔江分类系统(Armen Takhtajan:1910年6月10日－2009年11月13日)系统渐渐显得过时。加上当时许多研究，涉及了分子技术的引用，为许多分类群提供了明确的种系发生学上的数据。即使亚美因·塔赫塔江亦投注极大的心力于其系统的完善，但被子植物分类学上一个新的种系发生学的面相应被重新提出，尤其针对科与目等高阶分类群的分类。植物种系发生学组于是提出此APG系统。

方法

APG (1998年)选择相当数量的单源的亚科分类群，如此对于被子植物的高阶分类极有为用。但对于此分类群的正式分类处理，与予以种系发生学上的命名实则不同，命名上当时仍存在诸多争议。APG采用了《国际植物命名法规》的方式，为科级及目级的分类群命名。

关于目级以上的分类，APG特别提出传：习惯上使用的目级以上分类群概念，与命名上的优先律的命名概念经常造成冲突，在寻求平衡此冲突时，APG特别强调其处理并非依法(命名法规)为之。

分类群的界线

依单系群概念界定分类群。如此，种以上阶层被定义或界定时，其演化序列未予以指明，如此可以方便沟通，特别是为科级及目级的分类群定义其范围及属于系统树架构的位置时。

界定分类群时若有替代性的选择，APG会选择具容易辨识的形态衍征，并参考解剖、生化、发生等特征。

在科级的分类时，依单系群概念，许多小科势必被界定出来而不是在传统的大科之中，这样的争议亦在于在目以上的分类群。

分类群的命名

目以上的分类群：本系统并未使用传统的分类阶层学名：如门、纲等，而是使用一般性的名词定义“分支”，例如单子叶植物分支、真双子叶植物分支、蔷薇分支、菊分支等。

目的定义与界定：许多目的学名之采用，考虑到其大小，通常涵盖约10至20个科。同时许多小目被界定出来，由于其为单系群，且其亲缘关系已确立，因此不放在未确定群而成为一个目。

参考文献

Angiosperm Phylogeny Group,An ordinal classification for the families of flowering plants, Annals of the Missouri Botanical Garden, 1998, 85 (4): 531–553 ，retrieved 2011-06-29。

Angiosperm phylogeny group. 2003.An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG II. Botanical Journal of the Linnean Society 141: 399–436.PDF档 (英文)，retrieved 2011-06-29。

Angiosperm phylogeny group. 2009.An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III. Botanical Journal of the Linnean Society 161: 105–121.PDF档 (英文)，retrieved 2011-06-29。

Stevens, P. F. 1986. Evolutionary classification in botany, 1960-1985. J. Arnold Arbor. 67: 313-339.

系统

基本分支如下：

被子植物angiosperms :单子叶植物分支monocots鸭跖草分支commelinids真双子叶植物分支eudicots核心真双子叶植物分支core eudicots蔷薇分支rosidsI类真蔷薇分支eurosids III类真蔷薇分支eurosids II菊分支asteridsI类真菊分支euasterids III类真菊分支euasterids II

参见颜色示意图

APG系统下设分类包括40个目和462个科，下列表中开始部分是没有分到任何一个分支内的科或目。有的科分布地域非常狭小或新分出的科，尚未有通用的汉语译名。

被子植物分支angiosperms无油樟科Amborellaceae木兰藤科Austrobaileyaceae白桂皮科Canellaceae金粟兰科Chloranthaceae菌花科Hydnoraceae八角茴香科Illiciaceae睡莲科Nymphaeaceae +莼菜科Cabombaceae大花草科Rafflesiaceae五味子科Schisandraceae腺齿木科Trimeniaceae林仙科Winteraceae金鱼藻目Ceratophyllales金鱼藻科Ceratophyllaceae樟目Laurales香皮茶科Atherospermataceae腊梅科Calycanthaceae腺蕊花科Gomortegaceae莲叶桐科 Hernandiaceae樟科Lauraceae杯轴花科Monimiaceae坛罐花科Siparunaceae木兰目Magnoliales番荔枝科Annonaceae单室木兰科Degeneriaceae帽花木科Eupomatiaceae舌蕊花科Himantandraceae木兰科Magnoliaceae肉豆蔻科Myristicaceae胡椒目Piperales马兜铃科Aristolochiaceae短蕊花科Lactoridaceae胡椒科Piperaceae三白草科Saururaceae单子叶植物分支monocots白玉簪科Corsiaceae草科Japonoliriaceae纳茜菜科Nartheciaceae无叶莲科Petrosaviaceae霉草科Triuridaceae菖蒲目Acorales菖蒲科Acoraceae泽泻目Alismatales泽泻科Alismataceae水蕹科Aponogetonaceae天南星科Araceae花蔺科Butomaceae丝粉藻科Cymodoceaceae水鳖科Hydrocharitaceae水麦冬科Juncaginaceae黄花绒叶草科Limnocharitaceae波喜荡草科Posidoniaceae眼子菜科Potamogetonaceae川蔓藻科Ruppiaceae芝菜科Scheuchzeriaceae岩菖蒲科Tofieldiaceae大叶藻科Zosteraceae天门冬目Asparagales百子莲科Agapanthaceae龙舌兰科Agavaceae葱科Alliaceae石蒜科Amaryllidaceae知母科Anemarrhenaceae吊兰科Anthericaceae星捧月科Aphyllanthaceae天门冬科Asparagaceae独尾草科Asphodelaceae芳香草科Asteliaceae非洲菝葜科Behniaceae香水花科Blandfordiaceae澳韭兰科Boryaceae铃兰科Convallariaceae矛花科Doryanthaceae萱草科Hemerocallidaceae异菝葜科Herreriaceae风信子科Hyacinthaceae仙茅科Hypoxidaceae鸢尾科Iridaceae鸢尾蒜科Ixioliriaceae毛石蒜科Lanariaceae异蕊草科Laxmanniaceae兰科Orchidaceae蓝星科Tecophilaeaceae紫灯花科Themidaceae刺叶树科Xanthorrhoeaceae血剑草科Xeronemataceae薯蓣目Dioscoreales水玉簪科Burmanniaceae薯蓣科Dioscoreaceae蒟蒻薯科Taccaceae肉质腐生科Thismiaceae毛柄花科Trichopodaceae百合目Liliales六出花科Alstroemeriaceae金梅草科Campynemataceae秋水仙科Colchicaceae百合科Liliaceae菝葜木科Luzuriagaceae黑药花科Melanthiaceae垂花科Philesiaceae菝葜藤科Rhipogonaceae菝葜科Smilacaceae露兜树目Pandanales环花草科Cyclanthaceae露兜树科Pandanaceae百部科Stemonaceae翡若翠科Velloziaceae鸭跖草分支commelinoids阿波波达草科Abolbodaceae凤梨科Bromeliaceae多须草科Dasypogonaceae匍茎草科Hanguanaceae苔草科Mayacaceae偏穗草科Rapateaceae槟榔目Arecales槟榔科Arecaceae鸭跖草目Commelinales鸭跖草科Commelinaceae血皮草科Haemodoraceae田葱科Philydraceae雨久花科Pontederiaceae禾本目Poales苞穗草科Anarthriaceae刺鳞草科Centrolepidaceae莎草科Cyperaceae二柱草科Ecdeiocoleaceae谷精草科Eriocaulaceae须叶藤科Flagellariaceae独蕊草科Hydatellaceae拟苇科Joinvilleaceae灯心草科Juncaceae禾本科Poaceae袖珍棕榈科Prioniaceae帚灯草科Restionaceae黑三棱科Sparganiaceae梭子草科Thurniaceae香蒲科Typhaceae黄眼草科Xyridaceae姜目Zingiberales美人蕉科Cannaceae闭鞘姜科Costaceae蝎尾蕉科Heliconiaceae兰花蕉科Lowiaceae竹芋科Marantaceae芭蕉科Musaceae鹤望兰科Strelitziaceae姜科Zingiberaceae真双子叶植物分支eudicots黄杨科Buxaceae双颊果科Didymelaceae清风藤科Sabiaceae昆栏树科Trochodendraceae +水青树科Tetracentraceae山龙眼目Proteales莲科Nelumbonaceae悬铃木科Platanaceae山龙眼科Proteaceae毛茛目Ranunculales小檗科Berberidaceae星叶草科Circaeasteraceae +独叶草科Kingdoniaceae领春木科Eupteleaceae木通科Lardizabalaceae防己科Menispermaceae罂粟科Papaveraceae +荷包牡丹科Fumariaceae+蕨叶草科Pteridophyllaceae毛茛科Ranunculaceae核心真双子叶植物分支core eudicots鳞枝树科Aextoxicaceae智利藤科Berberidopsidaceae五桠果科Dilleniaceae洋二仙草科Gunneraceae香灌木科Myrothamnaceae葡萄科Vitaceae石竹目Caryophyllales玛瑙果科Achatocarpaceae番杏科Aizoaceae苋科Amaranthaceae钩枝藤科Ancistrocladaceae翼萼茶科Asteropeiaceae落葵科Basellaceae仙人掌科Cactaceae石竹科Caryophyllaceae龙树科Didiereaceae双钩叶科Dioncophyllaceae茅膏菜科Droseraceae露叶毛毡苔科Drosophyllaceae瓣鳞花科Frankeniaceae粟米草科Molluginaceae猪笼草科Nepenthaceae紫茉莉科Nyctaginaceae非洲桐科Physenaceae商陆科Phytolaccaceae蓝雪科Plumbaginaceae蓼科Polygonaceae马齿苋科Portulacaceae棒木科Rhabdodendraceae肉叶刺茎藜科Sarcobataceae油蜡树科Simmondsiaceae闭籽花科Stegnospermataceae柽柳科Tamaricaceae檀香目Santalales铁青树科Olacaceae山柚子科Opiliaceae桑寄生科Loranthaceae羽毛果科Misodendraceae檀香科Santalaceae虎耳草目Saxifragales枫香科Altingiaceae连香树科Cercidiphyllaceae景天科Crassulaceae交让木科Daphniphyllaceae茶藨子科Grossulariaceae小二仙草科Haloragaceae金缕梅科Hamamelidaceae鼠刺科Iteaceae芍药科Paeoniaceae扯根菜科Penthoraceae齿蕊科Pterostemonaceae虎耳草科Saxifragaceae四果木科Tetracarpaeaceae蔷薇分支rosids单果树科Aphloiaceae燧体木科Crossosomataceae西兰木科Ixerbaceae刺球果科Krameriaceae美洲苦木科Picramniaceae川苔草科Podostemaceae旌节花科Stachyuraceae省沽油科Staphyleaceae三裂科Tristichaceae蒺藜科Zygophyllaceae牻牛儿苗目Geraniales花茎草科Francoaceae牻牛儿苗科Geraniaceae +高柱花科Hypseocharitaceae鞘叶树科Greyiaceae杜香果科Ledocarpaceae蜜花科Melianthaceae曲胚科VivianiaceaeI类真蔷薇分支eurosids I卫矛科Celastraceae蒜树科Huaceae梅花草科Parnassiaceae +微形草科Lepuropetalaceae木根草科Stackhousiaceae葫芦目Cucurbitales四柱木科Anisophylleaceae秋海棠科Begoniaceae马桑科Coriariaceae棒果木科Corynocarpaceae葫芦科Cucurbitaceae野麻科Datiscaceae四数木科Tetramelaceae豆目Fabales豆科Fabaceae远志科Polygalaceae皂皮树科Quillajaceae海人树科Surianaceae壳斗目Fagales桦木科Betulaceae木麻黄科Casuarinaceae山毛榉科Fagaceae胡桃科Juglandaceae杨梅科Myricaceae南青冈科Nothofagaceae马尾树科Rhoipteleaceae太果木科Ticodendraceae金虎尾目Malpighiales钟花科Achariaceae槲树果科Balanopaceae油桃木科Caryocaraceae金壳果科Chrysobalanaceae藤黄科Clusiaceae毒鼠子科Dichapetalaceae古柯科Erythroxylaceae大戟科Euphorbiaceae合丝花科Euphroniaceae大风子科Flacourtiaceae毛药树科Goupiaceae亚麻藤科Hugoniaceae香膏科Humiriaceae金丝桃科Hypericaceae包芽树科Irvingiaceae粘木科Ixonanthaceae裂药花科Lacistemataceae亚麻科Linaceae王冠草科Malesherbiaceae金虎尾科Malpighiaceae水母柱科Medusagynaceae金莲木科Ochnaceae小盘木科Pandaceae西番莲科Passifloraceae非洲核果木科Putranjivaceae羽叶树科Quiinaceae红树科Rhizophoraceae杨柳科Salicaceae杯盖花科Scyphostegiaceae三角果科Trigoniaceae时钟花科Turneraceae堇菜科Violaceae酢浆草目Oxalidales土瓶草科Cephalotaceae牛栓藤科Connaraceae火把树科Cunoniaceae杜英科Elaeocarpaceae酢浆草科Oxalidaceae孔药花科Tremandraceae蔷薇目Rosales钩毛树科Barbeyaceae大麻科Cannabaceae伞树科Cecropiaceae朴科Celtidaceae八瓣果科Dirachmaceae胡颓子科Elaeagnaceae桑科Moraceae鼠李科Rhamnaceae蔷薇科Rosaceae榆科Ulmaceae荨麻科UrticaceaeII类真蔷薇分支eurosids II瘿椒树科Tapisciaceae十字花目Brassicales叠珠树科Akaniaceae +钟萼木科Bretschneideraceae藜木科Bataceae十字花科Brassicaceae番木瓜科Caricaceae澳远志科Emblingiaceae环蕊科Gyrostemonaceae刺枝树科Koeberliniaceae池花科Limnanthaceae辣木科Moringaceae瘤药树科Pentadiplandraceae木犀草科Resedaceae刺茉莉科Salvadoraceae夷白花菜科Setchellanthaceae烈味三叶草科Tovariaceae旱金莲科Tropaeolaceae锦葵目Malvales红木科Bixaceae +弯子木科Cochlospermaceae半日花科Cistaceae地果莲木科Diegodendraceae龙脑香科Dipterocarpaceae锦葵科Malvaceae文定果科Muntingiaceae沙莓科Neuradaceae旋花树科Sarcolaenaceae球萼树科Sphaerosepalaceae瑞香科Thymelaeaceae桃金娘目Myrtales双翼果科Alzateaceae使君子科Combretaceae隐翼科Crypteroniaceae异裂果科Heteropyxidaceae千屈菜科Lythraceae野牡丹科Melastomataceae谷木科Memecylaceae桃金娘科Myrtaceae方枝树科Oliniaceae柳叶菜科Onagraceae管萼科Penaeaceae裸木科Psiloxylaceae喙萼花科Rhynchocalycaceae蜡烛树科Vochysiaceae无患子目Sapindales漆树科Anacardiaceae薰倒牛科Biebersteiniaceae橄榄科Burseraceae番苦木科Kirkiaceae楝科Meliaceae白刺科Nitrariaceae +骆驼蓬科Peganaceae芸香科Rutaceae无患子科Sapindaceae苦木科Simaroubaceae菊分支asterids山茱萸目Cornales山茱萸科Cornaceae +珙桐科Nyssaceae假石南科Grubbiaceae绣球花科Hydrangeaceae水穗草科Hydrostachyaceae刺莲花科Loasaceae杜鹃花目Ericales猕猴桃科Actinidiaceae凤仙花科Balsaminaceae山柳科Clethraceae翅萼树科Cyrillaceae岩梅科Diapensiaceae柿树科Ebenaceae杜鹃花科Ericaceae福桂花科Fouquieriaceae银钟花科Halesiaceae玉蕊科Lecythidaceae蜜囊花科Marcgraviaceae紫金牛科Myrsinaceae假红树科Pellicieraceae花荵科Polemoniaceae报春花科Primulaceae捕蝇幌科Roridulaceae山榄科Sapotaceae瓶子草科Sarraceniaceae野茉莉科Styracaceae山矾科Symplocaceae厚皮香科Ternstroemiaceae四籽树科Tetrameristaceae山茶科Theaceae假轮叶科TheophrastaceaeI类真菊分支euasterids I紫草科Boraginaceae环生籽科Plocospermataceae二歧草科Vahliaceae绞木目Garryales桃叶珊瑚科Aucubaceae杜仲科Eucommiaceae绞木科Garryaceae五蕊茶科Oncothecaceae龙胆目Gentianales夹竹桃科Apocynaceae胡蔓藤科Gelsemiaceae龙胆科Gentianaceae马钱科Loganiaceae茜草科Rubiaceae唇形目Lamiales爵床科Acanthaceae海榄雌科Avicenniaceae紫葳科Bignoniaceae醉鱼草科Buddlejaceae腺毛草科Byblidaceae盘果木科Cyclocheilaceae苦苣苔科Gesneriaceae唇形科Lamiaceae狸藻科Lentibulariaceae苦槛蓝科Myoporaceae木犀科Oleaceae泡桐科Paulowniaceae胡麻科Pedaliaceae +角胡麻科Martyniaceae透骨草科Phrymaceae车前科Plantaginaceae夷地黄科Schlegeliaceae玄参科Scrophulariaceae密穗草科Stilbaceae四粉草科Tetrachondraceae马鞭草科Verbenaceae茄目Solanales旋花科Convolvulaceae田基麻科Hydroleaceae山醋李科Montiniaceae茄科Solanaceae楔瓣花科SphenocleaceaeII类真菊分支euasterids II五福花科Adoxaceae鳞叶树科Bruniaceae香茜科Carlemanniaceae弯药树科Columelliaceae +离水花科Desfontainiaceae寄奴花科Eremosynaceae南鼠刺科Escalloniaceae茶茱萸科Icacinaceae多香木科Polyosmaceae楔蕊花科Sphenostemonaceae智利木科Tribelaceae伞形目Apiales伞形科Apiaceae五加科Araliaceae假茱萸科Aralidiaceae夷茱萸科Griseliniaceae番茱萸科Melanophyllaceae海桐花科Pittosporaceae鞘柄木科Torricelliaceae冬青目Aquifoliales冬青科Aquifoliaceae青荚叶科Helwingiaceae叶茶藨科Phyllonomaceae菊目Asterales假海桐科Alseuosmiaceae雪叶科Argophyllaceae菊科Asteraceae头花草科Calyceraceae桔梗科Campanulaceae +半边莲科Lobeliaceae腕带花科Carpodetaceae陀螺果科Donatiaceae草海桐科Goodeniaceae睡菜科Menyanthaceae五膜草科Pentaphragmataceae石冬青科Phellinaceae卢梭木科Rousseaceae花柱草科Stylidiaceae川续断目Dipsacales忍冬科Caprifoliaceae黄锦带科Diervillaceae川续断科Dipsacaceae北极花科Linnaeaceae刺续断科Morinaceae败酱科Valerianaceae

注: "+ ..." 是一种建议选择，也可以单独分为一科。

系属不清的科： 蛇菰科Balanophoraceae多子科Bonnetiaceae心翼果科Cardiopteridaceae垂籽树科Ctenolophonaceae锁阳科Cynomoriaceae簇花草科Cytinaceae十齿花科Dipentodontaceae沟繁缕科Elatinaceae四棱果科Geissolomataceae单柱花科Hoplestigmataceae扁果树科Kaliphoraceae洋酢浆草科Lepidobotryaceae光果科Lissocarpaceae五翼果科Lophopyxidaceae毛丝花科Medusandraceae管花木科Mettenusiaceae帽蕊草科Mitrastemonaceae盔瓣花科Paracryphiaceae五列木科Pentaphylacaceae围盘树科Peridiscaceae斜翼科Plagiopteraceae单室木科Pottingeriaceae肋果茶科Sladeniaceae栓皮果科Strasburgeriaceae苦皮树科Tepuianthaceae

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