法庭配置

卢旺达国际刑事法庭总共分成4个审判分庭。其中3个审判分庭负责初审，另外1个则是负责上诉审。其中，常任法官共有16人，审案法官则有9人，总共有25名法官。

第一审判分庭

第二审判分庭

第三审判分庭

上诉分庭

检察机构

关于卢旺达国际刑事法庭的检察机构总共分成两部分：

“侦查部分”负责搜集和调查于1994年期间在卢旺达个人所可能涉及到该法院所管辖之罪的证据。

“控诉部分”则是负责所有案件在法庭上的攻防。

冈比亚的Hassan Bubacar Jallow为卢旺达国际刑事法庭之现任检察官。其于1994年到1984年间为冈比亚司法部的首席检察官（Attorney-General），之后于1998年到2002年间为冈比亚最高法院的法官之一，其于2003年9月15日被联合国安理会指派为卢旺达国际刑事法庭之检察官，用以取代卡拉‧德尔庞特（Carla Del Ponte）。

书记官处

书记官处负责整个卢旺达国际刑事法庭的行政和管理工作，同时也负责其他依据审判庭的证据与程序规则所指派的法律工作，另外，书记官处也是审判庭间的沟通管道。

书记官处以书记官长为首，其代表着联合国秘书长。现任的书记官长为塞内加尔的阿达马‧迪昂（Adama Dieng），其从2001年3月起被任命为卢旺达国际刑事法庭之书记官长。

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