机制

目前还不能完全确定这些自体免疫抗体的成因是什么。自体抗体所攻击的，大都是细胞核，或是细胞里的其他目标。随它们攻击目标的不同，有攻击“染色体”的，有攻击“(双链)DNA”的，有攻击“RNA”的，还有攻击“ENA（Extractable Nuclear Antigens）”的,等等许多种。由于不论“染色体”还是“(双链)DNA”还是“RNA”，还是“ENA”，都是构成细胞与我们身体必要的元素，所以免疫系统一旦将之视为仇敌，不断地攻击，就会造成我们的细胞与器官遭到破坏的严重后果。

事实上，由于自体抗体攻击的对象极为细微、复杂，所以自体抗体的种类也极为繁多。以攻击“ENA”的抗体，也就是所谓的“抗ENA抗体”(Anti-ENA Antibodies)而言，就可再细分为“抗Sm抗体”、“抗SS-A/Ro抗体”、“抗SS-B/ La抗体”、“抗Scl-70抗体”、“抗R抗体”等多种。

一种抗体，可能形成多种不同的病症。譬如说，“抗SS-A/Ro抗体”可能导致“干燥性综合症”，或者“红斑性狼疮”等等。

一种病症，也可能是由各种不同的抗体所导致。譬如说，“红斑性狼疮”可能是“抗SS-A/Ro抗体”所导致，但也可能是“抗Sm抗体”、“抗SS-B/ La抗体”等等所导致。

由于自体免疫的症状往往都有软组织关节疼痛的问题，而软组织关节疼痛又名风湿，所以许多医院中的“自体免疫科”又名“风湿免疫科”，而这些与“风湿”无关，但病征近似的免疫毛病则被归类为“类风湿问题”。

常见疾病

乳糜泻（Coeliac disease）

1型糖尿病（Type 1 Diabetes mellitus，T1DM；旧时称Insulin-dependent diabetes mellitus，IDDM）

系统性红斑性狼疮（SLE，System Lupus Erythematosus）

修格连氏症候群或干燥症候群（Sjögren"s syndrome）

多发性硬化症（MS，Multiple sclerosis）

桥本氏甲状腺炎（Hashimoto"s thyroiditis）

葛瑞夫兹氏病（Graves" disease）

自发性血小板缺乏紫斑症（idiopathic thrombocytopenic purpura）

类风湿性关节炎（RA，Rheumatoid arthritis）

再生不良性贫血

干癣(Psoriasis)

贝西氏症 (Behcet"s)

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