在所有新教派别中，英国国教和罗马天主教最相像，它和天主教最大的区别在于首脑不同:罗马天主教以教皇为普天下所有基督徒的唯一首脑，而安立甘派则把英国国王奉为首脑，谁继承英国王位，谁就担任教会首脑，直到今天仍然如此。

　　其他方面的差别，包括仪式、理论、教义、组织机构等差别都不大;当然，天主教教堂装潢华丽，宗教仪式也更加豪华，国教教堂就平实得多，仪式也比较简单。这样，新教派别就很多了:派、茨温利派、浸礼会派、加尔文派、安立甘派，等等。这些教派在教义、礼仪、宗教理论诸方面都有不少差别，但都有一个共同点，就是不承认教皇的权威，不承认罗马教廷。这使新教在那个时候具有思想解放的性质—一旦人们否认罗马教廷的精神权威，认为每一个人都有能力和上帝直接沟通，那么每一个人就都可以通过阅读圣经而对宗教做出自己的解释。这样，基督教仍然存在，对上帝的信念仍然存在，但自由的思考已经形成了，一百个人读圣经可以产生一百种理解。

　　就好比我给同学们布置作业，让你们读一本书，然后写读书笔记，除非你们互相抄袭，或者到网上下载，否则你们一百个人写来的作业应该是一百个样子，有一百种不同的感想。不要以为不相信宗教才能解放思想，其实在宗教的框架内也可以解放思想。这样，大家就能体会到宗教改革的巨大意义。不过，并不是天主教才对人们的思想造成束缚，新教可以同样固执，同样造成思想束缚。新教各派也信仰不同的人，和天主教对新教的没有两样。在那个宗教极端的时代，谁都把自己看作“上帝的选民”，是真理的拥有者，为了信仰，为了“真理”，为了“上帝的事业”，人们互相争斗，彼此打得死去活来。那个时代是宗教战争的时代，马丁·以后，西欧在差不多一个世纪里深陷在宗教战争中，不仅德意志如此，整个西欧都是这样，都在打仗，甚至中欧也在打，而战争的理由就是信仰不同。

　　一直要打到大家都意识到靠战争解决不了问题，谁也不能消灭谁，上帝其实没有站在任何人一边—直到那时，宗教战争才停止了，每一个教派都开始承认其他教派存在的权利。而其他教派也承认这个教派存在的权利，到那个时候，宗教纷争才平息下去，人们学会了相互容忍。于是，在1648年，战争各方签订威斯特伐利亚和约，各个教派都取得了存在的权利。但是，因信仰或意识形态不同而大打出手的现象并没有停止，直至现在，西方仍然以意识形态或政治制度为理由发动战争，并且把它说成是“解放”别人。不同的是，16、17世纪的宗教战争中，信仰的因素可能更强烈一些，人们有更加虔诚的信仰;而现在，意识形态被用作发动战争的借口，这些借口连发动战争的人都不相信。

　　我们看看现在中东的情况就可以知道是怎么回事。受到新教冲击，天主教岌岌可危，面对强大的冲击波，天主教几乎要崩溃。这时，天主教开始进行自我更新，这叫“反宗教改革”。“反”在这里，功不是“反面”的“反”“反动”的“反”，而是“反过来”“相反方向”的“反”。中国人常常把“反宗教改革”理解为“反对宗教改革”或抗拒宗教改革，这种理解并不对;“反宗教改革”的意思是反过来进行的宗教改革，那么，什么是反过来进行的宗教改革?马丁·的目标是摧毁现有体制，重建一个教会组织，教会由此产生。原有的教会就进行抵抗，抵抗的方式是它也改革，不过改革的目标是维护原有的体制和结构让现存教会延续下去，这就是“反宗教改革”。

　　所以反宗教改革也是改革只不过它的目标是维护现有体制、不让的改革将其摧毁。马丁·的出发点本来很单纯，他讨厌教会腐败，因而反对教会腐败;但反着反着就触及天主教的根了，最后变成“挖根运动”，要挖掉天主教的根，摧毁罗马教会。渐渐地，罗马教廷也看出了问题所在，问题就出在腐败上。所以，为了保护天主教会，最好的办法就是败，自己败，根治腐败把腐败清除了，地位也就巩固了一—当时的教廷就采取了这种对策。一连有好几个教皇都决心根治腐败，而且确实做得不错，这很不容易，因为自我革新非常艰难。

　　罗马教会中连着出现了几个廉洁的教皇，他们兢兢业业决心很大，把腐败的官员撤职了，任用有能力、有奉献精神的人担任高级职务，再由他们去撤换一层一层的腐败分子，最终把局面扭转过来，至少把非常严重的腐败现象克服了。这样，天主教会就重新站住脚，再一次取得信徒的信任;如果不出现这样的“反宗教改革”，天主教会可能早就崩溃了，早就没有了。在这个过程现了一个新的团体耶稣会”，它很有名。最早到中国来传播基督教的就都是耶稣会士，例如利玛窦、汤若望等。这些人很有奉献精神，带着一种宗教的狂热追求自己的理想。他们不是无能之辈，他们有知识，掌握着由文艺复兴熏陶而来的西方科学技术，并且有很高的人文素养。

　　这样一批人集结起来，组成一个新的传教团体叫耶稣会，并且得到教皇的认可。新团体的发起者叫依纳爵·罗耀拉，他原本从军，后来受伤退伍，组建这个团体后，就以军队的组织方式进行管理，最高的领导叫“将军”，就是他自己;在他之下，每一个层级都有一位指挥官，按军队等级称作“旅长”“团长”“连长”等，实行严格的军事化管理。入会时要宣誓无条件服从，要完成组织交给的任务。耶稣会在后来被很多人否定，有些人甚至将它描述为恐怖组织，专干杀人越货的勾当。在历史上，确实有耶稣会士运用暗杀手段清除异己，但另一方面，耶稣会又不乏像利玛窦、汤若望那样的人。耶稣会对恢复罗马天主教的地位与影响发挥了很大作用，它是“反宗教改革”中的一支重要力量。

　　此外还要向大家介绍特兰托宗教会议。从1545年开始几乎每年都要举行一次，在这些会议上，教会高层对天主教中有争议的理论、教义、礼拜仪式和基本原则等进行审查，最后得出的结论是:应该维护过去的传统，不对天主教做根本性的改动。反宗教改革也是成功的，在清除教会流弊方面，它最终与宗教改革殊途同归。并且，两种改革最终都和民族国家联系起来了:新教国家把新教作为民族的共同信仰，巩固了新生的民族国家;而天主教国家也把本国教会改造成国家的教会，用国家主权压倒了教会的权威。经过宗教改革和反宗教改革，一个普世的、全欧洲的罗马教会其实已经不存在了，所有的教会都变成了国家的教会，成了民族国家的精神机构，这是宗教改革和反宗教改革完成时最终出现的情况。

　　宗教改革造成基督教的第二次大分裂。第一次分裂发生在罗马帝国晚期，东西教会分裂，形成后来的东正教和天主教，分别存在于东欧和西欧。第二次分裂也有地理上的分界线:新教，不管属于哪一派，基本上分布在西欧北部和中部，如英国、北欧、德意志北方和低地国家;旧教即天主教基本上流行于西欧南部，包括法国、西班牙、意大利和德意志南方区域。这种情况一直到今天仍然差不多如此。