1995年，青海有本教寺院11座，住寺本教徒303人。历史悠久的寺院有:
　　多西寺  位于化隆回族自治县金源乡多西材。始建于宋朝，是化隆境内本教(白本)祖寺。1958年前，该寺有经堂1座10间，其他平房、昂欠多间，占地500平方米。1958年关闭。1980 年开放，经堂重新修缮，面貌一新。现有住寺本教徒54人。
　　下什塘寺，位于化隆回族自治县金源乡下什塘村。该寺是多西寺的属寺，与多西寺同时修建，1958年以前有经堂1座16间，占地500平方米。1958年关闭。1981年重新开放，整修经堂，另建诵经房9间，客房3间，伙房3间，现有住寺本教徒88人。
　　木合沙下寺，位于黄南藏族自治州同仁县曲库乎乡木合沙材。始建于15至16世纪。1958 年前有经堂l座80间，僧舍15院90间。1958年关闭。1982年开放，新扩建大经堂1座111间，佛堂1座，昂欠1院36间，僧舍19院，是青海最大规模的本教寺院。开办藏医诊疗所1处，常年为群众免费治病。现有住寺本教徒70人。
　　寺却毛，位于海南藏族自治州贵德县河西乡瓦家村。始建于1250年。寺主为却毛仓活佛。 1958年前有教徒30多人。1958年关闭。1983年开放，现有经堂1座50间，教徒32人。
　　亚秀麻寺，位于海北藏族自治州刚察县哈尔盖乡亚秀麻村。始建于1783年。1958年前有经堂4间，僧舍6间，住寺本教徒20人。1958年关闭。1990 年批准开放，新修经堂3间，嘛呢康1间，僧舍5间，占地100多亩。