早在成吉思汗灭西夏和窝阔台时代攻伐南来四川的战争中，蒙古军就进入了吐蕃最东北部地区，征服了一些部落。1240年，分封在凉州的阔端遣部将朵儿达率军进入乌思藏，不久退回。1244年，阔端再遣朵儿达入藏召请最有影响的宗教首领之一萨斯迦派座主萨斯迦班智达（简称萨班），于是萨班携侄八思巴和恰那朵儿只同来凉州。1247年，萨班与阔端议定了乌思藏归附蒙古的条款，遂致函宣谕各教派、各地区僧俗首领，这是乌思藏被纳入蒙古国治下的开始。蒙哥即位后，命和里“统土蕃等处蒙古、汉军仍前征进”（《元史・宪宗纪》）。藏文史料除记载这一支征土善军外，还记有另一支由朵儿伯台率领的军队于1252年奉旨进兵，完成了对这个地区的征服。次年，蒙哥遣使至乌思藏清查户口，划定地界并将富庶的必里公派辖地（拉萨东北止贡）划为自己的“供养地”（分邑），搽里八派辖地（拉萨附近）划为忽必烈的供养地，伯木古鲁派辖地（山南乃东县）划为旭烈兀的供养地，分别与这些教派结成领属性质的特殊“施供关系”。不久，又先后任命了这些地区的万户长。地区自九世纪中叶吐蕃王国崩溃以来，一直处于分裂割据状态达四个世纪，至此各地区（教派）割据势力都服属于蒙古，在蒙元朝统治下统一起来。
　　
　　蒙哥即位以后，命忽必烈出镇中原汉地，并领兵进征南宋。自窝阔台末年以来，蒙古攻宋战争一直没有进展。南宋以孟珙守京湖，招兵练卒，建立巩固的防务，在襄阳“以舟师横截汉水”，使敌兵不得渡，又在光州、黄州、蕲州和安丰间的大别山地区设立大小山寨，分兵把守；余�d守四川，令诸州择险要之地构筑山城，迁治于内，屯兵聚粮，扼守要道，相互呼应。忽必烈深知南宋防守严密，一时无法正面进攻，于是奏请先取大理，从侧后包抄南宋。1252年秋，忽必烈率领蒙、汉诸军及藩府侍从启行，以大将兀良合台总督军事。次年夏，驻六盘山；秋，出临洮，取道吐蕃之境（今四川西部），分三路进兵。冬，蒙古军渡过金沙江，降服了麽些（令丽江纳西族）诸部，进围大理城。大理国王段兴智与权臣高祥杀蒙古谕降使者，出城抵敌，大败，弃城遁去。忽必烈入城后，接受张文谦、刘秉忠等人意见，通令禁止，并命姚枢搜访大理图籍。1254年春，留兀良合台领兵继续攻略大理国未服诸部，以刘时中为宣抚使，自率其余军队北还。其年秋，兀良合台军围善阐（又称押赤，今昆明，时段兴智逃至此），发炮、纵火攻城。城陷，段兴智逃至昆泽，被俘。到1255年，大理国五城、八府、四郡之地相继被蒙古征服，置十九万户府分治之。云南自八世纪中叶南诏割据以来，历五百余年，至此也被并入蒙古治下，从而使云南地区与内地复归统一，对我国多民族国家的发展有重大意义。

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