昆仑岛属巴地头顿省管辖，岛上多蛇，故有“蛇岛”之称。该岛在《马可波罗游记》中以Condur之名出现，马可·波罗称昆仑岛是中国与印度海路上最重要的岛屿之一。
1702年，不列颠东印度公司在昆仑岛南部海岸建立了一个据点，但在1705年被摧毁了。1787年，百多禄奉阮福映之命前往巴黎，签订《法越凡尔赛条约》，其中规定法国为越南提供武器装备支持，越南将昆仑岛在内的几个重要据点割让给法国。但是后来阮福映以法国未能给予实质帮助为由，拒绝履行条约义务。
1861年，法国殖民政府在昆仑岛建立了著名的昆仑岛监狱，把许多反对殖民统治越南人关押在此。1954年，越南共和国接管了这个监狱，后来在越南战争结束后被关闭。1984年，昆仑岛成为自然保护区——昆仑岛国家公园。
