弗朗西斯科·吉列尔莫·弗洛雷斯·佩雷斯(西班牙语:Francisco Guillermo Flores Pérez,1959年10月17日-2016年1月30日)从1999年到2004年之间担任萨尔瓦多总统和民族主义共和联盟(ARENA)成员。
他是一位哲学家和经济学家。曾在阿默斯特大学学习哲学,曾获哲学、社会学、政治科学和经济学学位。曾任前总统阿尔弗雷多·克里斯蒂亚尼·布尔卡德的助手.历任国民议会议员、总统新闻秘书、总统府副部长和计划部长等职。并于1998年2月辞去了国民议会议长的职务,以参加总统竞选。1999年3月7日当选为萨尔瓦多总统,6月1日就职。弗洛雷斯并曾在任内四度访台。卸任后热心拉丁美洲民主化运动,并曾任“自由美洲协会”理事会主席。