赵应元(1531年-1584年),字文宗,号仁斋,陕西泾阳人。明朝政治人物,同进士出身。
嘉靖四十四年(1565年)登乙丑科进士,授四川华阳县知县。后补河南郏县知县,官至御史,巡按湖广。张居正父丧,湖广官员毕至,唯独应元不至,张居正心中不悦。都御史陈玠顺张居正意,弹劾赵应元。赵应元被迫弃官还乡。张居正死后后,经孙继先举荐,恢复官职,升南京大理寺右寺丞,卒于任上。